Da quello che scrivi sembrerebbe che hai impostato come target il Plc Emulator, questo target si riferisce al simulatore che viene eseguito sul PC. Nel simulatore non sono presenti funzioni ed FB embedded, quindi ecco perchè non ti appaiono nella finestra delle librerie in basso (Screenshot).
Per modificare il target devi utilizzare il menù Project -> Select Target e selezionare SlimLine, il progetto verrà automaticamente convertito. Ricordo che olltre alle funzioni ed FB embedded a corredo di LogicLab vi sono una serie di librerie con moltissime funzioni ed FB, fai riferimento al Manuale programmazione IEC61131-3 per un elenco completo. Ti rimando a questo post per ulteriori informazioni.